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药学系现设有高职药学、中职药剂2个专业。其中药学专业曾获得教育部、国家卫生计生委、国家食品药品监管总局和国家中医药管理局共同确定全国首批健康服务类示范专业,市级示范专业，具有悠久的办学历史，其前身是是1929年春创办的“北平市药学讲习所”。
药学系现有教职工32人，其中教师28人，教辅人员4人。专任教师中高级职称9人，中级职称10人;硕士以上 15人;市级教学名师1人，市级师德先进个人1人，市级优秀青年骨干教师3人。药学团队曾获得市级优秀创新团队称号。1项教学成果获得北京市优秀教学成果一等奖;1项实训教学软件获国家软件著作权;团队共编写正式出版教材33册，获得市级以上奖励20项，在核心期刊发表论文30余篇。药学系注重学生实践能力培养，校内建有药物制剂、药品质量检测、药学服务等四个实验实训中心，基地面积2360平方米，设备总值约1918万。同时建立了北大医院、友谊医院、华润医药集团、国药集团等校外实训基地26家。
药学系毕业生平均就业率为99.9%，平均对口就业率为99.1%。近3年8名学生在全国及北京职业技能竞赛中获得奖励。未来药学系将夯实发展基础、深化内涵建设，努力建设成为我国高技能药学人才培养基地。
教职工：32人
校内专任教师：28人
专教硕士以上学位：15人
主院校地址：北京市北京市房山区窦店镇下坡店村大窦路12号(北京网络职业学院院内)
第二院区地址：通州区玉带河西街24号
第三院区地址：通州区九棵树东路128号
