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医学技术系成立于2016年3月，设有医学影像技术专业、医学检验技术专业、医疗仪器维修技术专业、医学生物技术等四个专业。其中医学检验技术、医学影像技术专业为学院特色专业，医学检验技术专业2012年入选中央财政支持的“提升专业服务产业能力”项目。根据首都医疗卫生事业发展需求，面向北京地区医学检验技术等职业岗位群，培养具有创新精神、较高医学检验职业素养和较强职业技能的高技能型人才。
医学技术系教师团队始终以“团结、敬业、奉献、创新”为工作宗旨，形成了一套规范的日常教育教学运行和管理机制。现有专任教师14人，其中有高级讲师7人，讲师5人;教师均为大学本科以上学历，其中博士研究生1名，硕士研究生6名;;市级专业带头人1人，市级骨干教师2人，市级优秀青年骨干教师4人，北京市青年英才2人，并有一支由行业专家组成的较为稳定的外聘教师队伍。医学检验教师团队2007年度被评为北京市专业创新团队，承担院级科研课题7项，其中1项获得课题评选一等奖，1项获得二等奖，5项获得三等奖。在首届全国卫生职业院校检验专业教师检验技能竞赛中，有2名教师获得三等奖。
医学技术系始终坚持“以服务为宗旨，以就业为导向，校企合作、工学结合”的人才培养模式，注重专业技能训练和综合素质的培养，校内拥有医学影像技术专业、医学检验技术专业、医疗仪器维修技术专业3个实训中心，实训室面积达到2000余平方米，各类仪器设备总值近4千万元。各专业的办学过程始终是在行业的参与和指导下进行，成立了专业建设指导委员会，参与教学计划、课程标准和实验实训基地规划的论证，建立了以北京大学人民医院、首都医科大学附属宣武医院、友谊医院、积水潭医院、天坛医院、儿童医院、中国中医科学院广安门医院、中医药大学东方医院等三级甲等医院为主的学生毕业实习基地和以实习医院检验科骨干力量为主的实习带教教师队伍。毕业生以基础知识扎实、实践操作能力强、综合素质高得到用人单位的一致好评，就业率一直稳定在95%以上。
校内专任教师：14人
专教硕士以上学位：7人
主院校地址：北京市北京市房山区窦店镇下坡店村大窦路12号(北京网络职业学院院内)
第二院区地址：通州区玉带河西街24号
第三院区地址：通州区九棵树东路128号
