农牧工程系于2021年8月由原畜牧兽医系和原食品生物工程系合并组建而成。在多年的办学实践中，始终秉持“知行合一 厚德强技”的校训，坚持以立德树人为根本，以服务经济社会发展为宗旨，以促进就业为导向，为省内外农牧业及农业现代化发展培养了一大批高素质复合型技术技能人才。

农牧工程系是学院重点建设系部，系部注重专业发展，服务产业特色，打造品牌专业。2018年加入河北省现代畜牧职业教育集团(我院为理事长单位)，同年加入河北省现代农业职业教育集团(我院为副理事长单位)，为畜牧兽医高水平专业群建设单位，拥有河北省农业职业技能培训基地、现代农业实训基地。现设有：畜牧兽医专业(国家级骨干专业、河北省高水平专业群骨干专业)、动物医学专业(河北省高水平专业群重点建设专业)、宠物养护与驯导专业、宠物医疗技术专业、园林技术专业(院级教育教学改革试点专业)、现代农业技术专业(河北省高水平专业群建设专业)、现代农业技术专业 (生物发酵方向，河北省高水平专业群建设专业)、棉花加工与经营管理专业。现有在校生1500余人。毕业生就业率在98%以上。

师资力量雄厚，现有教职工53人，其中，教授8人，副高职级以上职称25人，博士研究生5人，河北省“三三三”人才3人，双师素质教师比例达74%，同时聘请10余名行业企业技术人员担任系内兼职教师，形成了一支职称结构、年龄结构、学历学缘结构合理，师德高尚、教学经验丰富、科研与实践能力突出的高水平教师团队。其中，畜牧兽医专业教师团队和现代农业技术专业教师团队被授予“河北省职业教育教师教学创新团队”称号。

农牧工程系目前拥有植物与植物生理、植物保护、花卉、食用菌、土壤肥料、数码显微互动、远程同步传输、基础兽医、临床兽医、预防兽医、遗传繁育、营养与饲料等专业实训室。教育教学设备总值3184万元，拥有意大利进口全数字化兽用彩色超声波诊断仪、活体采卵仪、倒置荧光显微成像系统、DNA序列分析电泳仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪等精密仪器设备。

多年来，坚持走产教融合、校企合作的办学之路，积极探索产学互动、学研结合、订单培训、现代学徒制教学模式改革，先后与中粮集团、君乐宝乳业有限公司、大北农、新瑞鹏宠物集团、温氏集团等知名企业开展现代学徒制和订单培养，校企共同制订人才培养方案，共同开发个性化课程，共同培养生产一线需要的高素质技术技能人才，实现课程内容与岗位标准对接，与企业生产实际的无缝对接。与光明乳业有限公司、北京德青源农业科技股份有限公司、沧州印象大运河农业生态文化产业园、青县司马庄科技园等多家企业有着长期稳定良好的合作关系，校外实习实训基地40余家。

我系始终坚持教学、科研和生产相结合的职业教学理念，注重学生能力培养和技能训练，造就了一批又一批适应市场需求的高素质技术技能人才，社会赞誉度高，学生就业前景广阔，毕业生呈现出供不应求的局面。多名毕业生因工作业绩突出，受到国家及省市领导接见并被多家主流媒体报道，为学院争得了荣誉。