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临床医学系成立于2012年，是学院重点建设院系之一。师资力量雄厚，拥有专任教师20人，其中博士2人、硕士10人、教授4人、副教授1人；“双师型”教师达90%；兼职教师20人。近5年有近20项省级科研课题获批立项，其中重点课题6项；发表论文40余篇，其中核心期刊12篇；主编、副主编、参编国家级教材20余部次；2018年荣获“学院首届科技先进集体”,2020年荣获“学院抗疫先进集体”。临床医学系开设有临床医学、预防医学、康复治疗技术、公共卫生管理、健康管理等5个专业。临床医学专业于2016年开始招生，当年该专业被江西省卫生健康委员会定为农村定向培养临床医学（公共卫生）人才专业。为了促进就业，自2017年开始，在原临床医学专业基础上又分出了医学影像、全科医学方向；公共卫生管理专业于2018年开始招生；康复治疗技术专业于2019年开始招生；健康管理专业于2020年开始招生；预防医学专业于2021年开始招生；目前为学院专业最多的系，在校生人数近1000人。
临床医学系拥有2个（临床类别、公卫类别）国家医师资格考试实践技能考试基地，其中公卫类别国家医师资格考试实践技能考试基地为江西省唯一的考试基地；拥有全省最先进的OSCE考站、在线考试中心、临床诊断思维训练中心、中医技术体验馆、诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、五官科学、康复医学等较先进的校内实训基地。拥有1所在建集医疗、养老、康复、教学一体的三级综合性直属附属医院及1所非直属附属医院。聘请省内知名教学专家、教学管理专家、临床专家组成了临床医学、预防医学、健康管理专业教学指导委员会，参加了国家级教学资源库（临床医学专业教学资源库）的建设工作。
临床医学系不断探索医学高职教育新模式，走产学研结合之路，构建“校企/院校合作”的人才培养模式，临床医学专业与浙江大学医学院附属第一医院北仑分院深度合作，开展小班床边教学；十分重视学生临床技能的培养，首次组队参加“2018年全国第二届高等职业院校临床医学专业技能大赛”，3名参赛选手同时荣获个人三等奖；第二次组队参加“2019年全国第三届高等职业院校临床医学专业技能大赛”，3名参赛选手全部荣获个人一等奖，实现大满贯。首届临床医学专业执业助理医师考试通过率为61%，远远高于全省全国的平均通过率。
校内专任教师：20人
校外兼职教师：20人
专教硕士以上学位：10人
教授、副教授：5人
双师素质教师占比：90%
主院校地址：江西省南昌市小蓝经济开发区汇仁大道689号(汇仁大道与金沙大道交汇处)
