学校自1958年建校初，即开设中医学专业。2004年学校升格专科后，组建中医系，开始招收专科层次中医学专业学生。现拥有中医学、中医骨伤、健康管理、中医养生保健4个专业，其中中医学专业为“国家创新行动计划骨干专业”“首批全国职业院校健康服务类示范专业”“山东省现代学徒制试点专业”，牵头制定山东省中医学专业教学指导方案;中医骨伤、健康管理、中医养生保健专业为“山东省中医学类品牌专业群”“山东省中医学高水平专业群”重点建设专业。

中医系下设中基中诊、中医内儿、中医外妇、中药方剂、中医经典、中医骨伤、中医养生保健、健康管理等8个教研室和经方研究所。拥有国家级中医药高等学校教学名师、全国职业教育先进个人、全国中医临床特色技术传承骨干人才、山东省名中医药专家、山东省中医药科普巡讲专家、山东省教学名师等一大批专家、学者。专任教师中教授12人、博士18人、硕士以上学历教师占92%，教学团队获评国家级职业教育教师教学创新团队、山东省教学团队、山东省黄大年式教师团队等荣誉称号。

中医系现有中医诊断实验实训中心、中医临床技能实验实训中心、中医五官实训中心、中医骨伤实验实训中心、健康管理实验实训中心、中医养生实验实训中心等8个实验实训中心;与行业、企业共建“校中厂”12个、“厂中校”98个;拥有非隶属关系附属医院18所。对接医疗卫生行业企业，与省内外141所二级以上中医医院或综合医院建立了长期稳定的合作关系。对接健康服务业，与上海银燕国际养生悬灸研究所、北京艾得火健康科技有限公司、青岛希莱雅(创美)国际集团等22家国内知名健康服务企业合作，创新的“中医学类专业三元嵌入式校企合作人才培养模式”获山东省教学成果一等奖，在全国同类院校中起到示范和带头作用。

中医系现拥有山东省新技术研发中心、山东省临床中药学重点学科等高水平科研平台，共参与国家自然基金课题4项，主持省级以上科研、教改课题56项，获得国家级教学成果二等奖1项，省级教学成果一等奖4项，二等奖4项，科技成果奖5项;建有省级专业教学资源库1个，省级精品课程8门，省级精品资源共享课程3门，省级继续教育课程2门;主编、副主编国家规划教材98部，发表专业论文150余篇。

中医系发挥科创团队、中医博士专家团、大学生志愿者资源优势，积极开展职业技能培训、继续教育、技术服务、科普教育、健康服务等项目，助力健康中国“十百千万”工程，推进中医药知识进社区、校园、乡村，为中医药行业和区域健康服务业经济发展作出了重要贡献。

中医系本着“团结青年、服务青年、发展青年、成就青年”的理念，依托专业特点及中医药特色优势，在校园文化活动、专业技能竞赛、创新创业教育、社会实践活动等方面服务于学生成长成才。突出个性培养，启动实施大学生个性化培养，开设中医养生、小儿推拿、中医骨伤、五运六气等专业方向，实现学生个性发展。重视技能提升，积极构建“三级递进式”专业技能竞赛体系，开展教育部“1+X”证书培训，不断提升学生技能水平。人才培养屡获佳绩，学生技能竞赛获全国中医大学生临床能力大赛一等奖、学生志愿服务团队荣获省级志愿服务金奖、学生创业团队荣获省“互联网+”大学生创新创业大赛金奖、“青春中医新媒体工作室”成功入选全国百强校媒。

中医系重视提升国际化办学水平，坚持服务于国家中医药“一带一路”建设，与俄罗斯、韩国、日本、菲律宾、马来西亚、加拿大等国家相关院校签署合作协议，为学生学历提升、留学生培训等提供平台，在搭建国际化交流合作平台、开发教学资源等方面取得了可喜成绩。