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医学技术系成立于2016年7月，由医学检验技术、康复治疗技术2个专业组建而成。
医学技术系成立以来，一直致力于专业建设，以“培养符合社会发展、顺应时代需求的具有各医学技术专业基础理论和实践操作技能、具备良好职业道德和职业素质的高端技术技能型人才”为目标，坚持以就业为导向，以能力为本位，以岗位要求和职业标准为依据，着力于为社会培养高质量应用型医学技术技能型专门人才。目前共招生302人。
本系秉承校企合作、工学结合的职业教育理念和精神，积极开展各专业与行业间的合作交流、探索国际交流合作的途径。
本系各专业均拥有实训基地，目前已建立了检验实训室、康复实训室，根据真实工作场景，配备先进的实验实训设备，满足理实一体化教学。
本系所依托的临床教学资源主要有临床教学医院，能满足所有的专业课程临床教学及实习。
主院校地址：云南省昭通市云南省昭通市昭阳区太平街道办事处桃园社区九组
